彩虹飞蜥在夜晚时的体色是不显眼的灰色,但是当太阳光照射彩虹飞蜥的体温发生变化后,它们的体色就会变为亮眼并且非常鲜艳的颜色。
彩虹飞蜥的特点是它带白色的下腹部, 迷棕色的后腿和尾部有一条纤细的明亮度条纹到中间和6到7个深斑到一侧的条纹。有一些雌雄异体。次级雄性, 雌性,和幼体拥有一个橄榄绿的头部。一个蓝色的身体和黄色的尾巴、头这是占有统治地位的雄性的特征。彩虹蜥蜴有一个大脑袋,一条长尾巴,完整发育的外耳孔和眼睑。这种蜥蜴也有边齿,不同类型的牙。雄性蜥蜴的最大长度是25厘米,雌性蜥蜴是20厘米(Harris 1964)。
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